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已经扣除的短信通知费用是否可以退回，具体需要根据情况而定。
如果是因为银行方的失误或特殊原因，如短信通知服务并非本人授权同意的，或银行系统出现错误导致扣费，那么可以与银行协商要求退回，在此过程中，需要向银行提供相关的证据和情况说明。
但如果是因为个人原因或账户状态导致的扣费，比如账户余额不足、账户状态异常等，那么已经扣除的短信通知费一般无法退回，在这种情况下，建议联系银行客服了解具体原因和解决方式。
能否退回已扣的短信通知费需要根据具体情况和银行的规定来确定，建议直接联系银行客服，了解详细情况和解决方案。